Прокуратура города Сосновый Бор провела проверку по жалобам работников ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» на нарушения их трудовых прав.
Проверка установила факты нарушения сроков выплаты заработной платы и других обязательных платежей, причитающихся  работникам общества.
Например, в нарушение требований трудового законодательства в день увольнения работника Е. работодателем не был произведен окончательный расчет; не была выплачена заработная плата и другие обязательные платежи еще 11 работникам.
В апреле 2012 года прокуратурой города в отношении генерального директора ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» было возбуждено дело об административном правонарушении по ч. 1 ст. 5.27 КоАП РФ (нарушение законодательства о труде и об охране труда).  
Тогда Государственная инспекция труда в Ленинградской области признала генерального директора ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» виновным и  назначила ему наказание в виде административного штрафа в сумме одна тысяча рублей.
Однако должных выводов после привлечения к административной ответственности генеральный директор ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» не сделал, действенных мер по соблюдению сроков выплаты заработной платы и расчета при увольнении перед работниками не предпринял.
В дальнейшем  еще ряд работников общества не получили причитающиеся им денежные средства и трудовые книжки в день увольнения, что повлекло за собой нарушение их трудовых и конституционных прав.
В соответствии со ст. 22 и ст. 136 Трудового кодекса РФ на  руководителя организации, возложена обязанность выплачивать работникам причитающуюся им заработную платы и иные установленные законом выплаты в установленные сроки. Однако руководитель ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» заработную плату и иные установленные законом выплаты в установленные законом сроки работникам не выплатил дважды в течение 2012 года.
В июне 2012 года прокуратурой Соснового Бора в отношении генерального директора ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» возбуждено дело об административном правонарушении по ч. 2 ст. 5.27 КоАП РФ (нарушение законодательства о труде и об охране труда должностным лицом, ранее подвергнутым административному наказанию за аналогичное административное правонарушение). По постановлению мирового судьи судебного участка № 65 г. Сосновый Бор генеральный директор ООО «АтомЭнергоИнжиниринг» признан виновным и ему назначено наказание в виде дисквалификации сроком на 1 (один) год.
Постановление мирового суда было обжаловано генеральным директором ООО, однако Сосновоборский городской суд Ленинградской области оставил решение мирового суда без изменения, жалобу без удовлетворения.